C40B

Satz von Verbindungen, die in einer genau angegebenen, räumlichen Verteilung vorliegen (Anordnung), z.B. in den Vertiefungen einer 96-well-Platte, an den in einem Ständer befestigten Stiften oder auf der Spitze von zu Bündeln zusammengefassten optischen Fasern.

Verfahren, das die Verwendung von Mikroorganismen, Enzymen, Vektoren oder Antikörpern einschließt.

Verfahren, das in vitro Selektionssysteme verwendet, die durch Evolution in Mischungen chemischer Verbindungen solche Komponenten anreichern, die ausgewählte Eigenschaften besitzen. Der Fachausdruck " gezielte molekulare Evolution" wird gewöhnlich dann verwendet, wenn das Verfahren auf Mischungen aus Makromolekülen angewendet wird (z.B. RNA Aptamere). Die ausgewählten Verbindungen werden anschließend unter Verwendung biochemischer Verfahren amplifiziert ("kopiert") (z.B. enzymatische, reverse Transkription von RNA Aptameren in DNA, PCR Vervielfältigung und schließlich Rück-Transkription in RNA), diese Vorgehensweise wurde an die organische Chemie angepasst und eröffnete einen neuen Zweig der kombinatorischen Chemie, die als "dynamische kombinatorische Chemie" bezeichnet wird, wobei die Anreicherung der (gewöhnlich niedermolekularen) Verbindungen mit einer ausgewählten Eigenschaft aus der Gleichgewichtsreaktion stammt, die eine bevorzugte Zerstörung und Wiedergewinnung der nicht ausgewählten Verbindungen durchführt.

Strategie, bei der ein Ersatzanalyt mit jedem Mitglied einer Bibliothek verbunden wird, um seine Struktur und/oder die Reaktionsabfolge, die bei seiner Herstellung verwendet wurde, nachzuverfolgen. Dies wird gewöhnlich durch die Verwendung von Tags/Labels erreicht, die an den Teilchen der festen Träger befestigt werden, auf denen die Bibliotheksmitglieder zusammengebaut werden.

Ein Satz von Verbindungen (eine Bibliothek), hergestellt durch kombinatorische Synthese. Eventuell bestehend aus einer Sammlung von Pools oder Unter-Bibliotheken.

Eine kombinatorische Synthese ist die Herstellung von Sätzen unterschiedlicher Einheiten durch die Kombination von Sätzen chemischer Bausteine, z.B. Reagenzien.

Eine Bibliothek enthalten in einem Mikroorganismus, einer Zelle oder einem Vektor ist eine Bibliothek, deren Mitglieder von dem jeweiligen biochemischen Stoff präsentiert werden, z.B. in einem Plasmid.

Verfahren, das die Bestimmung der Struktur eines Bibliotheksmitgliedes ermöglicht und/oder die Reaktionsabfolge seiner Herstellung, bestehend aus dem „Lesen“ (z.B. Strukturbestimmung) eines Ersatzanalyten (Code, Tag, Label) der mit dem genannten Bibliotheksmitglied verbunden ist.

Verfahren, bestehend aus der Unterteilung (normalerweise durch erneute Synthese oder durch Erstellung einer Teilbibliothek) eines Pools, der zu einem gewissen Grad die gewünschte Aktivität aufweist, um so einen Satz kleinerer Pools zu erhalten. Siehe auch iterative Dekonvolution.

Gezielte molekulare Evolution ist ein Verfahren zur Anreicherung einer Bibliothek an Mitgliedern, die eine Eigenschaft oder Aktivität von Interesse besitzen. Das Verfahren beinhaltet zyklische Arbeitsschritte wie die Verwendung einer Bibliothek, deren Durchmusterung nach der gewünschten Eigenschaft oder Aktivität und die Vervielfältigung der Treffer, um so die Ausgangsbibliothek für den nachfolgenden Zyklus zu erhalten.

"Mutationen" können im Vervielfältigungsschritt eingeführt werden, um so die Vielfalt innerhalb der Bibliothek zu erhöhen. Dieser Sachverhalt schließt die Aspekte der Erzeugung und des Screenings von Bibliotheken mit ein.

Eine Bibliothek, die von einem Mikroorganismus präsentiert wird, ist eine Bibliothek, die sich auf der Oberfläche eines solchen Mikroorganismus befindet, z.B. auf einem Bakterium. Siehe z.B. "Nature Biotechnology" (1997),15, Seite 29-34: "Display of heterologous proteins on the surface of microorganisms: from the screening of combinatorial libraries to live recombinant vaccines."

Eine Sammlung von Verbindungen (in Lösung) in einem dynamischen Gleichgewicht (z.B. sich gleichmäßig verändernd). Wenn sich die Zusammensetzung der Bibliothek in der Gegenwart eines Zielmoleküls, das selektiv an bestimmte Bibliotheksmitglieder bindet, verändert, dann wird die Verschiebung des Gleichgewichts zu einer Zunahme der Menge derjenigen Komponenten führen, die an das Zielmolekül mit einer relativ hohen Affinität binden. Eine dynamische Bibliothek enthält alle potentiell möglichen Kombinationen von Komponenten, die eine zufällige dynamische Verbindung eingehen, unabhängig davon, ob diese Kombinationen bei den gerade verwendeten Bedingungen vorliegen oder auch nicht. Es handelt sich um eine virtuelle Bibliothek. Eine reale Einheit wird bei Vorliegen eines Zielmoleküls erzeugt.

Ansatz einer Lösungsphasensynthese, der die Fähigkeit stark fluorierter Gruppen ausnutzt, um wässrige und die meisten organischen Lösungen in eine dritte Phase aufzuteilen, die aus einer fluorierten Lösung besteht. Die fluorierte Seitenkette kann dabei als löslicher Träger für die Synthese fungieren.

Die Bestimmung der exakten Eigenschaft, z.B. der chemischen Struktur oder der Sequenzabfolge eines bestimmten Bibliotheksmitgliedes oder einer bestimmten Untergruppe von Bibliotheksmitgliedern.

Eine Bibliothek, die als Gegenstand nicht existiert, sondern ausschließlich in elektronischer Form oder auf dem Papier erzeugt wird. Dies ist eine Art der virtuellen Bibliothek. Die Bausteine, die für eine solche Bibliothek erforderlich sind, existieren womöglich nicht und die chemischen Schritte für die Erstellung einer solchen Bibliothek wurden womöglich nicht getestet. Diese Bibliotheken werden für die Gestaltung und Bewertung möglicher Bibliotheken verwendet.

Ein Gerät speziell konstruiert zur Durchführung von mindestens zwei verschiedenen Arbeitsvorgängen, z.B. Synthese und Screening.

Verfahren zur Identifizierung aktiver Bibliotheksmitglieder, bestehend aus einer bestimmten Anzahl von Wiederholungen der Dekonvolutionsstrategie. Üblicherweise wird die Ausgangsbibliothek in nicht überlappende Teilmengen aufgeteilt. Die Teilmengen werden getrennt voneinander getestet (durchmustert) und diejenige mit der höchsten Aktivität wird identifiziert. Diese Teilmenge wird erneut als Sammlung einfacherer Teilmengen synthetisiert, die dann auf ihre Aktivität getestet werden. Dieses Verfahren wird so oft wiederholt, bis ein einziges Bibliotheksmitglied mit einer (idealerweise) hohen Aktivität identifiziert ist.

Eine Bibliothek ist eine erzeugte Sammlung einer Vielzahl von Verbindungen, Mikroorganismen oder anderen Substanzen. Die Sammlung ist nützlich als Test-Werkzeug zur Bestimmung, welches ihrer Mitglieder oder welche Teilmengen von Mitgliedern Aktivitäten oder Eigenschaften von Interesse besitzen. Eine Bibliothek könnte z.B. bestehen aus:

• einer Lösung
• einer physikalischen Beimengung
• einem geordneten oder ungeordneten Array
• einer Vielzahl von Mitgliedern auf einem festen Träger und an diesem befestigt, z.B. durch chemische Bindung, durch physikalische Anziehungskräfte oder durch Beschichtung.

Im Zusammenhang mit C40B umfasst dieser Ausdruck sowohl eine Synthese in der Lösung (z.B. Reaktionen in einer einzigen flüssigen Phase), als auch Synthesen in mehreren flüssigen Phasen (z.B. die mehr als eine flüssige Phase beinhalten). Letztere betreffen beispielsweise Synthesen die auf flüssigen, makromolekularen Verbindungen wie z.B. PEG (Polyethylenglykol) durchgeführt werden, auf Dendrimeren oder in denen das System eine Fluor-Kohlenstoff-Phase enthält ( fluorhaltige Synthese).

Bakterien, Aktinomyzeten, Pilze (z.B. Hefe), Viren, Menschen, Tiere, oder pflanzliche Zellen, Gewebe, Protozoen oder einzellige Algen.

Spezielle Verfahren zur Befestigung, wobei es auf die Art und Weise, wie die Moleküle auf dem festen oder flüssigen Träger gebunden sind, ankommt, z.B. durch elektrostatische Wechselwirkungen, die Ausbildung kovalenter Bindungen durch Cycloadditionsreaktionen oder durch Bestrahlung.

Verfahren bestehend aus dem Kontaktieren des Reaktionsmediums mit einem festen Träger nachdem eine Reaktion in der Lösung abgelaufen ist, um so die Reaktionsprodukte auf dem Säulenmaterial zu befestigen und einfach isolieren zu können.

Ein Linker, der bei Durchführung von zwei verschiedenen Reaktionen an Stelle einer einzigen Reaktion abgespalten wird, so dass dadurch eine größere Kontrolle über den Zeitpunkt der Freisetzung der Verbindung erhalten wird. In der Praxis wird das Säulenmaterial vor der Spaltung "aktiviert" (z.B. Spaltung durch nukleophile Substitution an einem zuvor alkylierten Sulfonamid-Säulenmaterial).

Bestimmung ob eine Bibliothek ein Mitglied oder Mitglieder enthält, die eine bestimmte Eigenschaft oder Aktivität von Interesse besitzen.

Synthetisches Verfahren, bei dem die Reaktionen auf einem festen Träger durchgeführt werden, üblicherweise in der Gegenwart eines Lösungsmittels, z.B. indem während der Erzeugung der Bibliothek ein oder mehrere Bausteine der Bibliothek an einen festen Träger gebunden sind (z.B. Polymer, Säulenmaterial, Glaskugeln).

Unlösliches, funktionalisiertes, polymeres Material, an dem Bibliotheksmitglieder oder andere Reagenzien befestigt sein können (häufig über einen Linker), welches es gestattet, die Bibliotheksmitglieder leicht abzutrennen (durch Filtration, Zentrifugieren etc.) von überschüssigen Reagenzien, löslichen Nebenprodukten oder Lösungsmitteln.

Synthese die in Lösung durchgeführt wird, z.B. sind dabei die Reaktanden und Reagenzien alle im Reaktionsmedium löslich (ungeachtet der Tatsache, dass beispielsweise ein geträgerter Katalysator während der Reaktion verwendet wird). Sie wird auch als "Synthese in Lösung" bezeichnet.

Linker, der keinen beliebigen Rest bei der gespaltenen Verbindung zurück lässt, z.B. einer, der durch ein Wasserstoffatom ersetzt wird.

Eine Bibliothek die nicht gegenständlich ist. Dieser Ausdruck umfasst zwei unterschiedliche Arten von Bibliotheken: In silico Bibliotheken und dynamische Bibliotheken.